Gli azionisti di FI.L.S.E. al 31.12.2020 sono:
- Regione Liguria
- Comune di Genova
- C.C.I.A.A. di Genova
- Autorità di Sistema Portuale del Mar Ligure Occidentale
- C.C.I.A.A. Riviere di Liguria – Imperia La Spezia Savona
- Città Metropolitana di Genova
- Autorità di Sistema Portuale del Mar Ligure Orientale
- Comune di Savona
- Provincia di Savona
- Comune di Imperia
- Comune della Spezia
- FI.L.S.E. S.p.A.